走进不科学 第238节（2 / 4）
一般来说。
如果是培养皿培育出的菌株，检测或者对比的难度往往都不高。
但对象若是自然界富集的样本，操作起来就比较麻烦了。
徐云所说的16s相似度检测，指的是核糖体小亚基的rna组分检测。
也就是16srrna。
这部分长度大约1500nt，不同物种略有差异，算是目前主流的九大新物检测步骤之一。
五分钟后。
裘生抬起头，对徐云道：
“老徐，准备好了，引物你觉得用啥？”
徐云想了想，很快道：
“1492r吧。”
“好嘞！”
半个小时后。
裘生抬起头，打了个响指：
“搞定，扩出来了，blast的密匙你有吧？”
徐云朝他竖起一根大拇指示意干得漂亮，随后走到操作台边，噼里啪啦的输了一大串密匙。
做过新种检测的同学应该都知道。
16s相似度检测的界限其实有些模糊，因为不同分类群的检测相似度阈值是不一样的。
比如有的是97％，有的是99％。
只是在通常情况下。
相似度超过97％的，就可以认为是一个物种。
相似度低于97％的，就可以认为是不同物种，进行下一阶段检测。
不过就是这样一种不太精细的检测手段，却依旧是很多新物检测迈不过去的一道坎：
大部分样本在经过检测之后，都会发现相似度在99.99％以上，与其他某某微生物是同一物种。
总而言之。
这项技术在定属方面还是靠谱的。
又过了一会儿。
裘生一脸惊喜的抬起头，声音骤然拔高了几分：
“老徐，相似度46.9％，46.9％！！”
“毫无疑问，这是一类新物！” ↑返回顶部↑
如果是培养皿培育出的菌株，检测或者对比的难度往往都不高。
但对象若是自然界富集的样本，操作起来就比较麻烦了。
徐云所说的16s相似度检测，指的是核糖体小亚基的rna组分检测。
也就是16srrna。
这部分长度大约1500nt，不同物种略有差异，算是目前主流的九大新物检测步骤之一。
五分钟后。
裘生抬起头，对徐云道：
“老徐，准备好了，引物你觉得用啥？”
徐云想了想，很快道：
“1492r吧。”
“好嘞！”
半个小时后。
裘生抬起头，打了个响指：
“搞定，扩出来了，blast的密匙你有吧？”
徐云朝他竖起一根大拇指示意干得漂亮，随后走到操作台边，噼里啪啦的输了一大串密匙。
做过新种检测的同学应该都知道。
16s相似度检测的界限其实有些模糊，因为不同分类群的检测相似度阈值是不一样的。
比如有的是97％，有的是99％。
只是在通常情况下。
相似度超过97％的，就可以认为是一个物种。
相似度低于97％的，就可以认为是不同物种，进行下一阶段检测。
不过就是这样一种不太精细的检测手段，却依旧是很多新物检测迈不过去的一道坎：
大部分样本在经过检测之后，都会发现相似度在99.99％以上，与其他某某微生物是同一物种。
总而言之。
这项技术在定属方面还是靠谱的。
又过了一会儿。
裘生一脸惊喜的抬起头，声音骤然拔高了几分：
“老徐，相似度46.9％，46.9％！！”
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